淋病经过药物治疗，自觉症状可能会有所好转，如尿频、尿痛症状减轻，尿道口脓性分泌物减少或消失，但往往留下使患者十分烦恼的症状：即尿道有持续性的刺痛、外阴部胀痛不适、尿急尿频等。
要知道，引起淋病的细菌——淋球菌，其耐药性成2~3倍增长，该菌对许多抗生素已不敏感，如磺胺药、青霉素、红霉素等。对淋球菌敏感的抗生素，如菌必治（又名为头孢三嗪、罗氏芬）、淋必治（壮观霉素）等，要根据病情轻重和病程长短采用不同的剂量及疗程。早期或病情轻者可用250毫克的菌必治，每日1针，连续注射3天；病程长者或病情较重者可用1克的菌必治，每日1针，连续注射7天。如果采用淋必治针治疗不仅要根据病情和病程注射1~7天不等，每次还要根据不同性别采用不同剂量。
重要的是，用药前和用药后必须做淋球菌镜检和培养，镜检和培养阳性才能投以药物。即使按以上方法治疗以后，还必须连续做三次淋球菌镜检和培养，三次全部阴性才能说明淋球菌已被清除。
值得注意的是，现在发现有相当多的淋病患者，即使严格按照以上常规疗法治疗，尿道分泌物或子宫颈分泌物做淋球菌镜检及培养3次均阴性，患者还存在许多自觉症状，如男性患者往往留有尿道刺痛、灼热感，阴囊胀痛，尿频尿急；女性患者有阴道不适、外阴瘙痒、白带增多等。
原来，这些淋病患者还合并有另一种病原体感染，即沙眼衣原体和解脲支原体。国内外已有报道40%~50%的淋病患者合并有沙眼衣原体和解脲支原体感染，医学上称为“非淋菌性尿道炎”，这两种病原体混合感染增加了淋病治疗的复杂性。为了彻底治疗淋病，在用药前和用药后还须取尿道或子宫颈分泌物作衣原体和支原体培养，阳性患者在使用足量有效的抗淋球菌抗菌素的同时，还得加用对衣原体和支原体有效的药物，如美满霉素、阿奇霉素、氟嗪酸等。选用以上一种，7天为1个疗程，一般使用1-2个疗程，直到复查衣原体和支原体培养阴性。
非淋菌性尿道炎的病原体除了由衣原体和支原体感染引起外，约有20%的非淋菌性尿道炎是由真菌（即霉菌）感染引起。用药前查得衣原体和支原体培养阴性者还须做真菌培养，真菌培养阳性者还得加服抗真菌药物，如氟康唑、特比奈芬、斯皮仁诺等，直到尿道或宫颈分泌物真菌培养阴性才算治愈。
还得提出的是，淋病患者还需排除合并有早期梅毒感染。用药前还须抽取静脉血做血清抗梅毒抗体检查，此化验称"TPHA"。对淋球菌有效的抗生素对梅毒螺旋体无效。在短期大剂量使用抗生素治疗淋病时，会掩盖或延迟潜伏性梅毒的症状，故进行淋病治疗时，还需每月做血清学检查，至少要3个月。
以上这些复杂的检验和治疗，必须具备一定规模的医疗单位才能胜任，所以说，淋病的治疗并不是那么简单容易的，奉劝淋病患者千万不要相信“一针灵”。
